发夹在基因测序中的双面角色,是工具还是挑战?

发夹在基因测序中的双面角色,是工具还是挑战?

在基因测序的复杂世界里,“发夹”结构,即PCR引物中的反向互补序列,扮演着至关重要的角色,它们作为引物的关键部分,能够启动DNA聚合酶的合成活动,从而在目标序列上复制出互补的DNA链,这一精妙的设计也带来了挑战:发夹结构容易形成二级结构,干扰PCR反应的进行,导致非特异性扩增或产物减少。

为了克服这一难题,科学家们开发了多种策略,如优化引物设计以减少发夹结构的形成、使用高保真DNA聚合酶以增强对二级结构的耐受性,以及引入热启动技术以在反应初期避免非特异性扩增,这些努力不仅展现了“发夹”作为工具的潜力,也揭示了其在基因测序中可能引发的挑战,如何平衡“发夹”结构的利用与控制,成为基因测序领域一个值得深入探讨的课题。

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